Posle Drugog svetskog rata od 1945
Prilikom osnivanja novoformiranog Istorijskog odeljenja 1. marta 1945. godine nije postojao nikakav arhivski materijal za ustrojavanje arhiva. Težište rada je bilo na prikupljanju arhivske građe i to prvo jedinica NOV i POJ, zatim neprijateljskih formacija 1941-1945. godine, koja je uglavnom, bila zaplenjena i nalazila se kod vojnih jedinica ili drugih ustanova. a nastojalo se da se prikupi i vojna arhiva koja je nastala do 1940. godine.
Generalštab JA naredio je 26.marta 1945. godine svim štabovima, jedinicama i pozadinskim vojnim vlastima da prikupe i pošanju Istorijskom odeljenju svu ratnu arhivu i svu dokumentaciju koja bi mogla poslužiti za obradu ratne vojne istorije. Prikupljanje arhivske građe neprijateljskih i kvislinških jedinica u Drugom svetskom ratu vršeno je paralelno sa prikupljanjem građe iz jedinica NOV i POJ. Građa neprijateljskih formacija 1941-1945. godine uglavnom je bila zaplenjena i nalazila se kod vojnih jedinica ili drugih ustanova.
Posle Drugog svetskog rata Vojni arhiv je raspolagao s nekoliko vagona prikupljene arhivske građe i težište je stavljeno na sređivanju iste. Nije bilo dovoljno radne snage i stručnog kadra, pa se učilo kroz praksu i na iskustvima drugih arhivskih ustanova u Beogradu. Za rad na sređivanju angažovan je veliki broj honorarnih službenika, uglavnom penzionisanih oficira Vojske Kraljevine Jugoslavije. U prvoj fazi rada bila je izvršena sistematizacija i klasifikacija celokupne arhivske građe. Arhivska građa podeljena je na tri grupe: arhivu vojske Kraljevine Srbije i vojske Kraljevine Jugoslavije, arhivu Narodnooslobodilačke vojske i partizanskih odreda i arhivu okupatorskih i kvislinških jedinica iz perioda Drugog svetskog rata.
Prvo se sređivala arhiva Narodnooslobodilačke vojske, zatim arhiva neprijateljskih i kvislinških jedinica i najzad arhiva srpske vojske do 1920. godine. Arhiva Vojske Kraljevine Jugoslavije u to vreme nije sređivana.