Nezavisna država Hrvatska, od 1941. do 1945. god.
Arhiva NDH je neposredno posle Drugog svetskog rata sređena u Vojnoistorijskom institutu. Arhivistički je sređeno i obrađeno 555 kutija građe za koje postoji sumarni i analitički inventar. Sumarni inventar sastoji se od tri knjige u kojima je izrađen pregled na nivou kratkog sadržaja kutije i vremenskog raspona građe u kutiji. Analitički inventar sastoji se od kartoteke u kojoj se nalazi pregled do nivoa dokumenta. Na osnovu dokumenata iz sređenog dela fonda objavljen je i prvi tom edicije „Zločini na jugoslovenskim prostorima u Prvom i Drugom svetskom ratu“ koji se odnosi na zločine u NDH tokom 1941. godine. Arhivska građa fonda NDH je u procesu digitalizacije.
Vojni arhiv je 1991. godine primio od bivšeg Saveznog sekretarijata za inostrane poslove arhivsku građu Ministarstva vanjskih poslova NDH koja nije arhivistički sređena. Građa ima 110 dužnih metara. Deo građe Pravnog i Političkog odjela registraturno je sređen. Za ostala odeljenja: Opće, Konzularno-gospodarsko i Odjel za novinarstvo i kulturu nema nikakvih pomoćnih pokazatelja. Krajem 2009. godine započeta je arhivistička obrada i sređivanje ovog dela fonda. Do sada je urađen popis delovodnih knjiga, imenskih i predmetnih registara i određena njihova pripadnost podfondovima, a time su i formirani podfondovi i pripremljena baza za dalje sređivanje arhivske građe koje je u toku.